Der Bahnhof Bärenstein ist der Endbahnhof der eingleisigen Hauptstrecke von Bad Güntersbrunn über dem Bahnhof Ernwald und die Haltestelle Johannestal. In Bärenstein beginnt zusätzlich eine 760 mm Schmalspurbahn. Das Heizhaus mit Bekohlung und Dieseltankstelle wird von der Normalspur und der Schmalspur gemeinsam genutzt. Die Gleisanlagen sind dafür teilweise als Drei- und Vierschienengleis ausgeführt.
Der schematische Plan zeigt schwarz die Normalspur und grün die Schmalspur.
Die Sicherungsanlage mit eigenem Stellwerk bedient Weichen und Formsignale nach altösterreichischer Bauform.
Die Sicherungsanlage steht mit dem nächsten Bahnhof in Verbindung, Streckenfreigabe und Signalstellung bewirken einen Streckenblock, der erst nach erfolgter Zugfahrt aufgehoben wird.
Die Schmalspurstrecke läuft zu Beginn parallel zur Hauptstrecke in einem Bogen zur Haltestelle Bärenstein Ort. Über das markante Brückenbauwerk geht es zur Haltestelle Teufelsmühle und weiter über die Drehbrücke zum Bahnhof Hubertus.
Besonders reizvoll sind immer die Parallelfahrten der Normalspur und der Schmalspur.