Wendeln ist der kleinste Bahnhof der Anlage, hat aber trotzdem eine recht interessante Gleisanordnung.
Der Name des Bahnhofes bezieht sich auf unsere mächtige zweigleisige, etwa 100 m lange Gleiswendel, die zum Bahnhof Unterwendeln im unteren Clubraum führt. Diese Wendel befindet sich unter dem Bahnhof Wendeln.
Als reiner Durchgangsbahnhof einer zweigleisigen Hauptstrecke mit einem Mittelgleis und einem kleinen Abstellgleis ist Wendeln mit einer Sicherungsanlage mit Formsignalen ausgestattet. Auch dieser Bahnhof ist in das Streckenblocksystem eingebunden.
Verschubtätigkeiten sind im Fahrplan vorgesehen, die Garnituren werden mit Entkupplern getrennt.